Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BRCA2P51587 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms