Protein–RNA interactions for Protein: P49750

YLPM1, YLP motif-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YLPM1P49750 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
YLPM1P49750 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
YLPM1P49750 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms