Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPIAP49247 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RPIAP49247 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPIAP49247 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms