Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTDSS1P48651 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTDSS1P48651 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms