Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms