Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GATA4P43694 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms