Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SLC1A1P43005 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms