Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA2P42262 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA2P42262 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms