Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MDH1P40925 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MDH1P40925 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MDH1P40925 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MDH1P40925 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms