Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PPARGP37231 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PPARGP37231 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PPARGP37231 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PPARGP37231 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms