Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN4AP35499 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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