Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTNNB1P35222 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTNNB1P35222 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms