Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CRABP1P29762 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CRABP1P29762 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms