Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP1P28562 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms