Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HTR2AP28223 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HTR2AP28223 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms