Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-DMAP28067 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms