Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRKACBP22694 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms