Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EPHA1P21709 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms