Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RAB4AP20338 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RAB4AP20338 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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RAB4AP20338 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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RAB4AP20338 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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RAB4AP20338 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RAB4AP20338 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RAB4AP20338 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RAB4AP20338 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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RAB4AP20338 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAB4AP20338 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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