Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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PTPRAP18433 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRAP18433 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRAP18433 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRAP18433 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPRAP18433 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PTPRAP18433 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PTPRAP18433 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PTPRAP18433 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PTPRAP18433 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PTPRAP18433 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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