Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VEGFAP15692 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms