Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM27P14373 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms