Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms