Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MTHFD1P11586 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms