Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ESRRAP11474 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ESRRAP11474 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms