Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms