Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL3P10147 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL3P10147 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3P10147 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3P10147 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCL3P10147 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms