Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HKR1P10072 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms