Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM225BP0DP42 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms