Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB1P08034 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB1P08034 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GJB1P08034 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GJB1P08034 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJB1P08034 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms