Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBP07199 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPBP07199 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPBP07199 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPBP07199 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPBP07199 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPBP07199 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CENPBP07199 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CENPBP07199 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms