Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTMAP06454 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTMAP06454 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTMAP06454 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTMAP06454 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTMAP06454 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms