Protein–RNA interactions for Protein: P04000

OPN1LW, Long-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1LWP04000 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
OPN1LWP04000 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms