Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms