Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN7O95471 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms