Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLSTN1O94985 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms