Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEBLO76041 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEBLO76041 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEBLO76041 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEBLO76041 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEBLO76041 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEBLO76041 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEBLO76041 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEBLO76041 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEBLO76041 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEBLO76041 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEBLO76041 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms