Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBOX1O75936 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms