Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA4O75335 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA4O75335 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms