Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GMDSO60547 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GMDSO60547 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms