Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1O43719 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms