Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms