Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HTRA2O43464 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HTRA2O43464 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms