Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR1CO15160 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR1CO15160 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms