Protein–RNA interactions for Protein: O14965

AURKA, Aurora kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AURKAO14965 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AURKAO14965 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AURKAO14965 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AURKAO14965 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AURKAO14965 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
AURKAO14965 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms