Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTDSP2O14595 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms