Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCER2I3L3R5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms