Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KNCNA6PVL3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KNCNA6PVL3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms