Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
E2F8A0AVK6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms