Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00312Q9Y6C7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms